Bioökonomie International 2020: Advantage - Neue und wertgebende Allele in der Kartoffel durch EcoTILLING und modernes Genome Editing

Abstract

Im Rahmen des Projekts "Advantage" sollen züchterisch bzw. industriell relevante Merkmale von Kartoffelpflanzen verbessert werden. Dies soll durch ein synergetisches Forschungs- und Entwicklungsprogramm in Chile und Deutschland erreicht werden. Zur Identifizierung neuer wertgebender Allele, sollen chilenische Wildkartoffel-varietäten bezüglich ihrer jeweiligen Zielgen-spezifischen Allelkombinationen untersucht werden (EcoTILLING). Zudem sollen Genotyp-/Phänotyp-Korrelationsanalysen durchgeführt werden, um Zusammenhänge zwischen den Allelkombinationen und den Merkmalsausprägungen zu aufzudecken. Darüber hinaus sollen wertgebende Defektallele in kommerziell nutzbaren Elite-Kartoffelvarietäten mittels CRISPR/Cas9 generiert und anschließend funktionell charakterisiert werden. Die Hauptaufgabe des Fraunhofer IME war die Generierung einer EcoTILLING-Population und das anschließende Screening dieser Population auf neue, rezessive Allele der Zielgene mittels Next-Generation-Sequencing mit anschließender Analyse der Sequenz- und phänotypischen Daten. Zu den Aufgaben des Fraunhofer IME gehörte weiterhin die Analyse der vom Partner IBBP generierten Genom-editierten Pflanzen auf CRISPR/Cas induzierte Mutationen mittels DNA Fragmentanalyse und Sanger Sequenzierung. Darüber hinaus erfolgte die phänotypische Analyse der TOC1 Mutationen durch das Fraunhofer IME.