EMBARK: Diagnostik und Überwachung der Antibiotikaresistenz: Entwicklung von Instrumenten, Technologien und Methoden für den globalen Einsatz - Data Mining und Datenanalyse

Abstract

Das EMBARK-Projekt hat sich auf die Entwicklung und Implementierung fortschrittlicher Technologien und Methoden zur Diagnose und Überwachung von Antibiotikaresistenzen konzentriert. Mit seinen umfassenden Forschungsaktivitäten hat das Projekt wesentlich zum globalen Verständnis und Management von Antibiotikaresistenzen beigetragen, indem es innovative Ansätze in der Datenanalyse und Methodenentwicklung vorangetrieben hat. Wichtige Ergebnisse des Projekts umfassen die Entwicklung und Hinterlegung neuer Modelle und Werkzeuge in öffentlichen Datenbanken (Deliverable D2), die den Zugang und die Nachnutzung der Forschungsoutputs verbessern. Im Rahmen von EMBARK wurde spezialisierte Software entwickelt (Deliverables D7 und D8), die darauf ausgerichtet ist, sowohl bekannte als auch neuartige Antibiotikaresistenzgene in metagenomischen Datensätzen zu identifizieren und vorherzusagen. Diese Werkzeuge verbessern die Genauigkeit und Effektivität der Überwachung von Antibiotikaresistenzen. Zudem wurde ein umfangreiches molekulares Profiling aller antimikrobiellen Resistenzgene entlang des Magen-Darm-Trakts von Hausmäusen durchgeführt (Deliverable D31), was tiefere Einblicke in die Verbreitung und das Vorkommen von Resistenzgenen bietet. Ein weiterer Schwerpunkt lag auf der Etablierung von Baselinewerten für AMR in verschiedenen Umgebungen (Deliverable D32), was es ermöglicht, Abweichungen von diesen Normwerten zu erkennen und potenzielle Risikobereiche für die Verbreitung von Resistenzgenen zu identifizieren. Diese Arbeit trägt dazu bei, gezielte Maßnahmen zur Eindämmung von AMR zu entwickeln und umzusetzen. Das EMBARK-Projekt hat somit nicht nur das wissenschaftliche Verständnis erweitert, sondern auch praktische Anwendungen in der Überwachung von AMR gefördert, die zur globalen Gesundheitssicherheit beitragen. Datei-Upload durch TIB