curATime - Hochauflösende 4D Proteomik- und Lipidomik Plattform zur Entschlüsselung molekularer Pathomechanismen der Atherothrombose (diAMs); Teilprojekt C
Abschlussbericht zum Teilvorhaben "diAMs-P5" im Vorhaben "curATime - Cluster für Atherothrombose und individualisierte Medizin"
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Wir haben im Rahmen von AP4.1 ein umfassendes plasmaspezifisches Lipid-Metabolit-Protein-Netzwerk entwickelt, das experimentelle Protein-Interaktionen mit enzymatischen und genetischen Daten verknüpft und über hyperbolische Einbettungen funktionelle Distanzen visualisiert. Dieses Netzwerk wurde im R-Shiny-Paket OMINT zuganglich gemacht. Darauf aufbauend haben wir in AP4.2 das Webtool GeneDiseaseDrugNetwork (GDDN) entwickelt, das Gen-sets statistisch über PubMed-Literatur und MeSH-Begriffe mit Krankheiten verknüpft. Bei der Analyse der ProsPECTUS-Proteomik-Daten identifizierte das Tool Entzündung als zentralen Faktor sowie regulatorische miRNAs (z. B. miR-155). Zudem integriert GDDN eine automatisierte Priorisierung zugelassener Wirkstoffe basierend auf Relevanz, regulatorischer Wirkung, Spezifizität und Bindungsaffinität.