Filters

More filters

2019 - 201972020 - 20249
Reset filters

Settings

Author: Razum, Matthias × Start date: 2019 × Has files: Yes ×

Search Results

Now showing 1 - 10 of 16
  • Thumbnail Image
    Item
    Archivierung und Publikation von Forschungsdaten: Die Rolle von digitalen Repositorien am Beispiel des RADAR-Projekts
    (Berlin : de Gruyter, 2016) Kraft, Angelina; Razum, Matthias; Potthoff, Jan; Porzel, Andrea; Engel, Thomas; Lange, Frank; van den Broek, Karina
    Disziplinübergreifendes Forschungsdatenmanagement für Hochschulbibliotheken und Projekte zu vereinfachen und zu etablieren – das ist das Ziel von RADAR. Im Sommer 2016 geht mit ‚RADAR – Research Data Repository‘ ein Service an den Start, der Forschenden, Institutionen verschiedener Fachdisziplinen und Verlagen eine generische Infrastruktur für die Archivierung und Publikation von Forschungsdaten anbietet. Zu den Dienstleistungen gehören u. a. die Langzeitverfügbarkeit der Daten mit Handle oder Digital Object Identifier (DOI), ein anpassbares Rollen- und Zugriffsrechtemanagement, eine optionale Peer-Review-Funktion und Zugriffsstatistiken. Das Geschäftsmodell ermutigt Forschende, die anfallenden Nutzungsgebühren des Repositoriums in Drittmittelanträge und Datenmanagementpläne zu integrieren. Publizierte Daten stehen als Open Data zur Nachnutzung wie etwa Data Mining, Metadaten-Harvesting und Verknüpfung mit Suchportalen zur Verfügung. Diese Vernetzung ermöglicht ein nachhaltiges Forschungsdatenmanagement und die Etablierung von Dateninfrastrukturen wie RADAR.
  • Thumbnail Image
    Item
    NFDI4Chem - A Research Data Network for International Chemistry
    (Berlin : De Gruyter, 2023) Steinbeck, Christoph; Koepler, Oliver; Herres-Pawlis, Sonja; Bach, Felix; Jung, Nicole; Razum, Matthias; Liermann, Johannes C.; Neumann, Steffen
    Research data provide evidence for the validation of scientific hypotheses in most areas of science. Open access to them is the basis for true peer review of scientific results and publications. Hence, research data are at the heart of the scientific method as a whole. The value of openly sharing research data has by now been recognized by scientists, funders and politicians. Today, new research results are increasingly obtained by drawing on existing data. Many organisations such as the Research Data Alliance (RDA), the goFAIR initiative, and not least IUPAC are supporting and promoting the collection and curation of research data. One of the remaining challenges is to find matching data sets, to understand them and to reuse them for your own purpose. As a consequence, we urgently need better research data management.
  • Thumbnail Image
    Item
    Digital research data: from analysis of existing standards to a scientific foundation for a modular metadata schema in nanosafety
    (London : BioMed Central, 2022) Elberskirch, Linda; Binder, Kunigunde; Riefler, Norbert; Sofranko, Adriana; Liebing, Julia; Minella, Christian Bonatto; Mädler, Lutz; Razum, Matthias; van Thriel, Christoph; Unfried, Klaus; Schins, Roel P. F.; Kraegeloh, Annette
    Background: Assessing the safety of engineered nanomaterials (ENMs) is an interdisciplinary and complex process producing huge amounts of information and data. To make such data and metadata reusable for researchers, manufacturers, and regulatory authorities, there is an urgent need to record and provide this information in a structured, harmonized, and digitized way. Results: This study aimed to identify appropriate description standards and quality criteria for the special use in nanosafety. There are many existing standards and guidelines designed for collecting data and metadata, ranging from regulatory guidelines to specific databases. Most of them are incomplete or not specifically designed for ENM research. However, by merging the content of several existing standards and guidelines, a basic catalogue of descriptive information and quality criteria was generated. In an iterative process, our interdisciplinary team identified deficits and added missing information into a comprehensive schema. Subsequently, this overview was externally evaluated by a panel of experts during a workshop. This whole process resulted in a minimum information table (MIT), specifying necessary minimum information to be provided along with experimental results on effects of ENMs in the biological context in a flexible and modular manner. The MIT is divided into six modules: general information, material information, biological model information, exposure information, endpoint read out information and analysis and statistics. These modules are further partitioned into module subdivisions serving to include more detailed information. A comparison with existing ontologies, which also aim to electronically collect data and metadata on nanosafety studies, showed that the newly developed MIT exhibits a higher level of detail compared to those existing schemas, making it more usable to prevent gaps in the communication of information. Conclusion: Implementing the requirements of the MIT into e.g., electronic lab notebooks (ELNs) would make the collection of all necessary data and metadata a daily routine and thereby would improve the reproducibility and reusability of experiments. Furthermore, this approach is particularly beneficial regarding the rapidly expanding developments and applications of novel non-animal alternative testing methods.
  • Thumbnail Image
    Item
    The RADAR Project - A Service for Research Data Archival and Publication
    (Basel : MDPI, 2016) Kraft, Angelina; Razum, Matthias; Potthoff, Jan; Porzel, Andrea; Engel, Thomas; Lange, Frank; van den Broek, Karina; Furtado, Filipe
    The aim of the RADAR (Research Data Repository) project is to set up and establish an infrastructure that facilitates research data management: the infrastructure will allow researchers to store, manage, annotate, cite, curate, search and find scientific data in a digital platform available at any time that can be used by multiple (specialized) disciplines. While appropriate and innovative preservation strategies and systems are in place for the big data communities (e.g., environmental sciences, space, and climate), the stewardship for many other disciplines, often called the “long tail research domains”, is uncertain. Funded by the German Research Foundation (DFG), the RADAR collaboration project develops a service oriented infrastructure for the preservation, publication and traceability of (independent) research data. The key aspect of RADAR is the implementation of a two-stage business model for data preservation and publication: clients may preserve research results for up to 15 years and assign well-graded access rights, or to publish data with a DOI assignment for an unlimited period of time. Potential clients include libraries, research institutions, publishers and open platforms that desire an adaptable digital infrastructure to archive and publish data according to their institutional requirements and workflows.
  • Thumbnail Image
    Item
    How Structured Metadata Acquisition Contributes to the Reproducibility of Nanosafety Studies: Evaluation by a Round-Robin Test
    (Basel : MDPI, 2022) Elberskirch, Linda; Sofranko, Adriana; Liebing, Julia; Riefler, Norbert; Binder, Kunigunde; Bonatto Minella, Christian; Razum, Matthias; Mädler, Lutz; Unfried, Klaus; Schins, Roel P.F.; Kraegeloh, Annette; van Thriel, Christoph
    It has been widely recognized that nanosafety studies are limited in reproducibility, caused by missing or inadequate information and data gaps. Reliable and comprehensive studies should be performed supported by standards or guidelines, which need to be harmonized and usable for the multidisciplinary field of nanosafety research. The previously described minimal information table (MIT), based on existing standards or guidelines, represents one approach towards harmonization. Here, we demonstrate the applicability and advantages of the MIT by a round-robin test. Its modular structure enables describing individual studies comprehensively by a combination of various relevant aspects. Three laboratories conducted a WST-1 cell viability assay using A549 cells to analyze the effects of the reference nanomaterials NM101 and NM110 according to predefined (S)OPs. The MIT contains relevant and defined descriptive information and quality criteria and thus supported the implementation of the round-robin test from planning, investigation to analysis and data interpretation. As a result, we could identify sources of variability and justify deviating results attributed to differences in specific procedures. Consequently, the use of the MIT contributes to the acquisition of reliable and comprehensive datasets and therefore improves the significance and reusability of nanosafety studies
  • Thumbnail Image
    Item
    Lokal betrieben, remote gepflegt – Software für ein Datenrepositorium in Kooperation implementieren
    (Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2022) Landwehr, Matthias; Schneider, Gabriel; Hofmann, Stefan; Razum, Matthias; Soltau, Kerstin; Heuveline, Vincent; Bisheh, Nina
    Die Universität Konstanz deckt ihren Bedarf nach einem institutionellen Forschungsdatenrepositorium mit der von FIZ Karlsruhe angebotenen Lösung „RADAR Local“. Als Alternative zu einer Eigenentwicklung wurde das Datenrepositorium als hybrides Modell mit Repositorien-Software und Archivierung auf lokaler Infrastruktur implementiert. Dabei stellt FIZ Karlsruhe die etablierte Repositorien-Software RADAR zur Verfügung, wartet und betreibt sie aus der Ferne und passt sie nach Kundenwunsch an. Um die parallele Installation und Pflege der RADAR-Software auf mehreren lokalen Instanzen effizient bewältigen zu können, hat FIZ Karlsruhe vorab den Automatisierungsgrad der betroffenen Prozesse in der Software-Entwicklung, in der Systemkonfiguration und im Deployment erhöht. Dies wurde durch den Einsatz von Container-Virtualisierung wie Docker und Docker Swarm sowie mit Orchestrierungswerkzeugen wie Ansible erreicht. Der zeitliche Aufwand und der personelle Ressourcenbedarf reduzieren sich dadurch für die Universität Konstanz und als Ergebnis erhält sie ein gepflegtes Repositorium auf dem aktuellen Stand der Technik. Gleichzeitig erfordert diese Betriebsvariante eine intensive Auseinandersetzung mit dem jeweiligen Geschäftsmodell und den technischen Rahmenbedingungen des Anbieters, eine genaue Kostenkalkulation sowie möglicherweise Kompromisse oder Abstriche bei individuellen Wünschen.
  • Thumbnail Image
    Item
    Knowledge Graph enabled Curation and Exploration of Nuremberg's City Heritage
    (Aachen, Germany : RWTH Aachen, 2021) Tietz, Tabea; Bruns, Oleksandra; Göller, Sandra; Razum, Matthias; Dessì, Danilo; Sack, Harald; Paschke, Adrian; Rehm, Georg; Al Qundus, Jamal; Neudecker, Clemens; Pintscher, Lydia
    An important part in European cultural identity relies on European cities and in particular on their histories and cultural heritage. Nuremberg, the home of important artists such as Albrecht Dürer and Hans Sachs developed into the epitome of German and European culture already during the Middle Ages. Throughout history, the city experienced a number of transformations, especially with its almost complete destruction during World War 2. This position paper presents TRANSRAZ, a project with the goal to recreate Nuremberg by means of an interactive 3D tool to explore the city's architecture and culture ranging from the 17th to the 21st century. The goal of this position paper is to discuss the ongoing work of connecting heterogeneous historical data from various sources previously hidden in archives to the 3D model using knowledge graphs for a scientifically accurate interactive exploration on the Web.
  • Thumbnail Image
    Item
    NFDI4Chem - Fachkonsortium für die Chemie
    (Marburg : Philipps-Universität, 2021) Ortmeyer, Jochen; Schön, Florian; Herres-Pawlis, Sonja; Jung, Nicole; Bach, Felix; Liermann, Johannes; Neumann, Steffen; Popp, Christian; Razum, Matthias; Koepler, Oliver; Steinbeck, Christoph
    Als Fachkonsortium für die Chemie hat sich NFDI4Chem innerhalb der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) gebildet. In diesem Beitrag stellt sich das Konsortium kurz vor und legt seine zentralen Ziele und wichtigsten Verbesserungen für das Forschungsdatenmanagement (FDM) in der Chemie sowie die praktischen Heraus-forderungen dar. Die Vision von NFDI4Chem ist die umfassende Digitalisierung und Vernetzung aller Prozesse im Umgang mit Forschungsdaten in der chemischen Forschung. Beginnend mit der Erzeugung der Daten, über deren Verarbeitung und Analyse bis hin zur Publikation wird eine modulare, vernetzte Infrastruktur aus Software-Tools, elektronischen Laborjournalen und Datenrepositorien entwickelt und bereitgestellt, die Forschende im Laboralltag unterstützt. Die Digitalisierung wird begleitet durch die Entwicklung von Minimalinformationen für Datenpublikationen, bestehend unter anderem aus Standards für Daten- und Metadatenformate sowie Ontologien zur semantischen Beschreibung. Seine Aufgaben verfolgt das NFDI4Chem-Konsortium wissenschaftsgeleitet und mit dem klaren Ziel, eine intuitiv und effizient nutzbare Infrastruktur zu entwickeln. Das Gestalten eines kulturellen Wandels, gemeinsam mit der wissenschaftlichen Community, zur Etablierung und Akzeptanz eines FAIRen Umgangsmit Daten ist daher ein weiteres wichtiges Element der NFDI4Chem-Aktivitäten.
  • Thumbnail Image
    Item
    Das RADAR Projekt: Datenarchivierung und -publikation als Dienstleistung - disziplinübergreifend, nachhaltig, kostendeckend
    (München : VDB, 2014) Razum, Matthias; Neumann, Janna
    Die Nachvollziehbarkeit und Reproduzierbarkeit wissenschaftlicher Erkenntnisse basiert zunehmend auf digitalen Daten. Deren Publikation, Verfügbarkeit und Nachnutzung muss im Rahmen guter wissenschaftlicher Praxis gewährleistet werden. Das Projekt RADAR geht diese Herausforderung durch die Etablierung einer generischen Infrastruktur für die Archivierung und Publikation von Forschungsdaten an. Dafür vereinen fünf Projektpartner aus den Informations- und Naturwissenschaften (FIZ Karlsruhe, TIB in Hannover, KIT/SCC, LMU München und IPB Halle) ihre Kompetenzen. Durch enge Kooperation mit Wissenschaftler/innen, Datenzentren, Fachgesellschaften und Verlagen wird eine bedarfsgerechte Entwicklung der Infrastruktur sichergestellt. RADAR richtet sich an zwei Zielgruppen: Projekte (d. h. Forscher/innen) und Institutionen. Es verfolgt dabei einen zweistufigen Ansatz: ein disziplinübergreifendes Einstiegsangebot zur formatunabhängigen Datenarchivierung mit minimalem Metadatensatz und ein erweitertes Angebot mit integrierter Datenpublikation. Der thematische Schwerpunkt liegt bei den wissenschaftlichen Disziplinen im „long tail of science“, in denen Forschungsdateninfrastrukturen meist noch fehlen. RADAR erlaubt eine temporäre oder – im Falle einer Datenpublikation – eine zeitlich unbegrenzte Datenarchivierung. Das angestrebte Geschäftsmodell zielt auf einen sich selbst tragenden Betrieb mit einer Kombination aus Einmalzahlungen und institutionellen Angeboten ab. RADAR ist als Baustein der internationalen Informationsinfrastruktur geplant, der sich über Schnittstellen auch in weitere Datenmanagement-Dienste Dritter integrieren lässt.
  • Thumbnail Image
    Item
    NFDI4Chem - Deliverable D3.3.1: Gap analysis report for selected repositories
    (Genève : CERN, 2023) Bach, Felix; Binder, Kunigunde; Christian Bonatto, Minella; Lutz, Benjamin; Razum, Matthias
    The deliverable 3.3.1 “Gap analysis report for selected repositories” aims both to identify gaps in the coverage regarding data types or disciplines and to close them through adjustments or, if necessary, new developments. In order to accomplish that, the TA3-team performed a gap analysis of the existing relevant repositories by means of individual interviews with the repository leaders. The interview consisted of a series of questions ranging from general information up to metadata standards and ontology, data contents, technical information about Authorisation and Authentication Infrastructure (AAI), API, services and functionality, operating environment as well as software architecture and workflows. The interviews will serve to establish the current degree of maturity as well as the operational fitness of the selected repositories and to derive suitable recommendations aiming to fulfil the yet missing requirements.