PANDA: Personalisierte ANalyse Der wirkstoffAktivität bei Bauspeicheldrüsenkrebs

Abstract

Das Projekt PANDA (Personalized ANalysis for Drug Activity in pancreatic cancer) verfolgte das übergeordnete Ziel, bestehende Drug-Screening-Daten nachzunutzen und gezielt für eine personalisierte Behandlung von Bauchspeicheldrüsenkrebs nutzbar zu machen. Hierfür wurden vorhandene bioinformatische Werkzeuge, die bisher in dem Onkopus Framework für die Interpretation von Genvarianten von einzelnen Patienten genutzt wurden, weiterentwickelt für die Analyse von genetischen Profilen von Kohorten. Als Datenbasis wurden die Ergebnisse eines Drug-Screens und weitere genetische Daten der verwendeten Zelllinien genutzt. Durch die Nachnutzung der Daten und Tools mit einigen Erweiterungen sollten die bereits entwickelten Tools in einem neuen Kontext genutzt werden und dies anhand von existierenden Daten demonstriert werden. Die in dem Projekt erzielten Ergebnisse sollten in einer Publikation beschrieben werden, die weiter entwickelten Tools sind als Open-Source verfügbar und fließen in das ursprüngliche Framework zurück Dabei umfassten das Vorhaben folgende wissenschaftliche Arbeitsziele: • Die Weiterentwicklung des bestehenden MTB-Reporting-Frameworks (Onkopus) zur Analyse von Drug-Screening-Daten. • Die Nachnutzung der Drug-Screen-Daten und die genetischen Profile der Zelllinien der Klinischen Forschergruppe 5002. • Die Validierung der Ergebnisse durch die Verwendung des bestehenden Datensatzes.